I Mörkret vid tidens ände får vi stifta bekantskap med den mörka materien och den mörka energin som fysikerna fortfarande inte fått grepp om. Vi utforskar de mörka tidsåldrarna före Big Bang, får en skymt av hur det gick till när vårt universum skapades och följer historien in i en avlägsen och osäker framtid.